怀孕三个月一般不建议药流，此时胎儿较大，药流成功率较低且风险较高，通常需选择人工流产手术。药物流产适用于妊娠49天内的早期妊娠，超过此时间可能因胚胎组织残留导致大出血或感染。
药物流产通过米非司酮片联合米索前列醇片终止妊娠，其原理是阻断孕激素受体并诱发宫缩。但妊娠12周时胎盘已形成，子宫对药物敏感性下降，完全流产概率不足60%，可能出现不全流产需二次清宫。部分患者服药后出现剧烈腹痛、持续出血超过两周或发热等感染征兆，需紧急处理。药物流产失败还可能因绒毛残留引发子宫复旧不良、宫腔粘连等长期并发症。
极少数妊娠10-12周孕妇在严密监护下尝试药流，需住院观察并使用加倍剂量药物。但仍有较高概率因胚胎组织排出不全需手术干预，且出血量常超过300毫升。存在瘢痕子宫、贫血或凝血功能障碍的孕妇绝对禁忌药流，可能发生子宫破裂或失血性休克。
终止3个月妊娠更推荐采用负压吸引术联合钳刮术，在超声引导下可一次性清除妊娠组织。术后需遵医嘱服用益母草颗粒促进子宫收缩，使用头孢克洛分散片预防感染，必要时静脉滴注缩宫素。流产后应卧床休息3天，1个月内禁止盆浴及性生活，定期复查超声确认宫腔恢复情况。若出现持续腹痛或异常分泌物增多需及时返院检查。