孕期有甲减可能影响胎儿，但孩子不一定会有甲状腺功能减退。孕期甲状腺功能减退可能由母体甲状腺激素不足、自身免疫性甲状腺炎、碘缺乏等因素引起，需通过甲状腺功能检查明确诊断。
母体甲状腺激素对胎儿神经系统发育至关重要，尤其在妊娠早期胎儿甲状腺未发育完全时，母体甲状腺激素是唯一来源。若孕期甲减未得到有效控制，可能影响胎儿智力发育，增加早产、低出生体重等风险。多数情况下，孕期甲减通过规范治疗可有效控制，胎儿出生后甲状腺功能通常正常。部分新生儿可能出现暂时性甲状腺功能异常，与母体甲状腺抗体通过胎盘或碘过量等因素有关，多数在出生后数周内自行恢复。
极少数情况下，胎儿可能因遗传因素或先天性甲状腺发育异常导致永久性甲状腺功能减退，需通过新生儿筛查早期发现。先天性甲状腺功能减退症患儿需终身接受甲状腺激素替代治疗，早期干预可避免智力障碍和生长发育迟缓。
孕期确诊甲减应严格遵医嘱使用左甲状腺素钠片，定期监测甲状腺功能，保持促甲状腺激素在妊娠特异性参考范围内。产后需对新生儿进行足跟血筛查，若发现甲状腺功能异常应及时转诊至儿科内分泌科。哺乳期母亲继续用药对婴儿安全，无须中断母乳喂养。日常需保证适量碘摄入，避免过量补碘，定期复查甲状腺功能及抗体水平。