肛瘘手术一般需要住院3-7天，具体时间与手术方式、术后恢复情况等因素有关。
肛瘘手术住院时间主要受手术复杂程度影响。单纯性低位肛瘘采用瘘管切开术，创伤较小，术后恢复快，通常住院3-5天即可出院。复杂性高位肛瘘需进行挂线术或肛瘘切除术，创面较大，术后需观察引流情况，住院时间可能延长至5-7天。术后若出现感染、出血等并发症，需延长住院时间进行抗感染治疗或二次处理。住院期间需每日换药，医生会根据创面愈合情况决定出院时间。术后24小时内需卧床休息，之后可逐步恢复日常活动，但应避免久坐或剧烈运动。饮食需从流质逐渐过渡到普食，保持排便通畅。
出院后需定期复查，术后1周内需返院检查创面愈合情况。居家护理需保持肛门清洁，便后用温水坐浴，避免粪便污染伤口。穿宽松棉质内衣，减少局部摩擦。若出现发热、肛门剧烈肿胀或渗液增多，需及时就医。术后2周内避免提重物或骑自行车等活动，1个月内禁止性生活。饮食上多摄入高纤维食物如燕麦、西蓝花，预防便秘。