肛瘘手术通常需要住院1-7天，具体时间与手术方式、术后恢复情况有关。
肛瘘手术住院时长主要取决于手术复杂程度和个体恢复差异。对于单纯性低位肛瘘，采用瘘管切开术等简单术式时，住院时间较短，约1-3天即可出院。这类手术创伤较小，术后疼痛可控，患者能较快恢复日常活动。若为复杂性高位肛瘘或合并感染，需行挂线疗法、皮瓣推移术等复杂操作时，住院时间可能延长至3-7天。这类手术创面较大，需观察引流情况并预防感染，住院期间需定期换药和监测体温等指标。术后恢复良好的患者，医生评估无感染、出血等并发症后即可安排出院。部分医疗机构开展日间手术模式，对符合条件的单纯性肛瘘患者可实现24小时内出入院，但需确保家中具备规范护理条件。
肛瘘术后应注意保持会阴清洁，每日用温水或高锰酸钾溶液坐浴2-3次，每次10-15分钟。饮食宜选择高纤维食物如燕麦、西蓝花等预防便秘，避免辛辣刺激食物。术后1-2周内避免久坐和剧烈运动，可遵医嘱使用复方角菜酸酯栓、马应龙麝香痔疮膏等药物促进创面愈合。出院后需按医嘱定期复查，若出现发热、创面渗液增多或剧烈疼痛应及时返院就诊。术后恢复期建议穿宽松棉质内衣减少摩擦，睡眠时可采用侧卧位减轻局部压力。