卵泡发育不良能否自愈需结合具体病因判断，部分生理性因素可自行改善，病理性因素通常需要干预治疗。
卵泡发育不良可能与精神压力、过度节食等生理性因素有关。长期焦虑或情绪波动可能影响下丘脑-垂体-卵巢轴功能，导致卵泡生长迟缓，调整心态、保证充足睡眠后部分人群可逐渐恢复。短期内极端饮食控制造成营养不良时，补充优质蛋白、维生素E等营养素，卵泡发育可能随体质改善而好转。部分女性在青春期或围绝经期出现的暂时性卵泡发育异常，也可能随激素水平自然调整而缓解。
多囊卵巢综合征、卵巢早衰等病理性因素导致的卵泡发育不良通常无法自愈。多囊卵巢综合征患者存在胰岛素抵抗及高雄激素血症，可能表现为卵泡不破裂或发育停滞，需通过药物调节内分泌。卵巢早衰患者因卵泡储备耗竭，可能出现持续性的卵泡生长障碍，需采用激素替代治疗。甲状腺功能减退、高泌乳素血症等内分泌疾病若未纠正原发病，卵泡发育问题也难以自行恢复。子宫内膜异位症引发的卵巢功能损伤，常需手术或药物干预。
建议存在月经紊乱、不孕等症状的女性进行性激素六项、超声监测等检查明确病因。日常需保持规律作息，避免过度减肥，适当摄入豆制品、坚果等富含植物雌激素的食物。病理性因素患者应遵医嘱使用来曲唑片、枸橼酸氯米芬胶囊等促排卵药物，或采用戊酸雌二醇片、黄体酮胶囊等激素疗法，避免盲目等待自愈延误治疗时机。