肛周脓肿通常建议手术治疗，但部分患者可通过药物治疗、物理治疗等方式缓解症状。肛周脓肿的治疗方式主要有抗生素治疗、中药坐浴、局部热敷、引流术辅助、饮食调理等。
抗生素治疗适用于感染较轻的肛周脓肿，常用药物包括头孢克肟分散片、阿莫西林克拉维酸钾片、甲硝唑片等，需在医生指导下使用。中药坐浴可选用清热解毒类中药如黄柏、苦参等煎水熏洗，每日重复进行可减轻局部炎症。局部热敷能促进血液循环，缓解疼痛肿胀，使用40-45℃温水毛巾敷于患处，每次持续15分钟。对于小型脓肿，医生可能采用穿刺引流代替手术，排出脓液后配合抗感染治疗。饮食上需避免辛辣刺激食物，增加膳食纤维摄入，保持排便通畅减少肛门压力。
肛周脓肿患者日常需保持会阴清洁干燥，排便后可用温水清洗并用柔软纸巾轻拭；选择透气棉质内裤并每日更换；避免久坐久站，每小时活动5分钟改善局部血液循环；出现发热、疼痛加剧或脓液增多时应立即就医，防止感染扩散引发败血症或肛瘘等并发症。未手术患者需定期复查，观察脓肿变化，若保守治疗无效仍需考虑手术治疗。