附睾囊肿通常不需要药物治疗，多数可通过观察随访或手术切除处理。附睾囊肿的治疗方式主要有保守观察、手术切除、穿刺抽液、中药调理。
1、保守观察
体积较小且无症状的囊肿建议定期超声复查，避免剧烈运动或局部压迫刺激。
2、手术切除
直径超过2厘米或伴有疼痛感染的囊肿需行附睾囊肿切除术，术后需预防感染。
3、穿刺抽液
对于暂时不宜手术者可在超声引导下行囊肿穿刺抽液，但复发概率较高。
4、中药调理
部分患者可尝试具有活血散结功效的中药，但须在中医师指导下使用。
日常应避免久坐压迫阴囊，穿着宽松内裤，若出现红肿热痛等感染症状需及时就医。