脑炎可能遗留后遗症，后遗症发生概率与病情严重程度、治疗时机等因素相关，常见类型包括认知障碍、运动功能障碍、癫痫发作及语言障碍。
1、认知障碍
部分患者可能出现记忆力减退或注意力不集中，与脑实质损伤有关，需通过认知康复训练改善。
2、运动障碍
肢体无力或平衡失调常见于脑干或小脑受累者，物理治疗和运动训练有助于功能恢复。
3、癫痫发作
脑炎后异常放电可导致继发性癫痫，需长期服用丙戊酸钠、左乙拉西坦等抗癫痫药物控制。
4、语言障碍
优势半球受损患者可能出现失语，言语治疗配合多奈哌齐等改善脑代谢药物可促进恢复。
建议康复期进行营养支持并定期神经科随访，早期干预可显著改善预后。