两者是有本质性区别的，肠炎是肠道的炎症表现，肠癌是肠道的恶性肿瘤。肠炎患者主要表现为腹痛、腹泻稀水便和粘液脓血便，持续时间不长，肠道内没有占位性病变，口服抗感染药物有效，经治疗可长期生存；肠癌主要表现为腹痛、腹泻、排便习惯改变、便血、腹部肿块等，可持续时间较长，肿瘤可侵及肠道黏膜、粘膜下层，进展期可侵入固有肌层，甚至侵犯周围组织，向淋巴和远处脏器转移。服用抗感染药物无效，需手术治疗或化疗，预后则取决于早期诊断与手术能否根治。
经常患肠炎的患者建议及早进行肠镜检查除外肠道的肿物，很多肠道的肿瘤是在肠炎的基础上发展而来，应在疾病早期发现诊断，利于根治。