肛瘘通常需要尽早手术治疗，避免病情加重或反复感染。肛瘘是肛周脓肿破溃后形成的慢性感染性管道，自愈概率极低，手术是根治的主要方式。
肛瘘未及时治疗可能导致感染范围扩大，形成复杂瘘管或引发肛周蜂窝织炎。长期慢性炎症刺激可能增加癌变风险。部分患者因瘘管位置较浅、症状轻微，可能暂时选择保守治疗，但需定期复查。若出现发热、剧烈疼痛或脓液增多，需立即就医。
术后需保持肛门清洁干燥，避免久坐或剧烈运动。饮食宜清淡，多摄入富含膳食纤维的蔬菜水果，减少辛辣刺激食物。每日温水坐浴有助于促进创面愈合，遵医嘱定期换药并观察伤口恢复情况。若出现红肿渗液等异常，应及时复诊。