小儿消化性溃疡的临床表现多不典型。可以下几种表现：
新生儿与小婴儿的消化性溃疡起病多较急，多以穿孔、出血就诊，常常掩盖原发疾病。早期常表现为哭闹、拒食，很快出现呕吐、哎血及便血，确诊较为困难。如发生腹膜炎，则腹胀明显，相应中毒症状明显，甚至出现呼吸困难等症状。
幼儿消化性溃疡的主要症状为反复脐周疼痛，无明显时间规律性，但进食后常加重，易被误诊。部份病儿以呕吐为主要表现，往往食欲差，发育不良或消瘦。
年长儿的消化性溃疡临床表现比较典型，多诉上腹部疼痛，部位局限于胃或十二指肠部位，有时可牵扯到背和肩胛部。进食后发生疼痛者多为胃溃疡，饭前或夜间疼痛者多为十二指肠溃疡，进食后常可缓解。一些患儿伴幽门痉挛而发生呕吐、嗳气和便秘。偶可见呕血、血便及胃穿孔。体检时，剑突下压痛或脐上部出现痛过敏。部分病例出现胃酸增高。如可见胃液带血或粪便潜血阳性，则对诊断有特殊的帮助。