临床上不同的致病菌种可有不同的临床表现，但共同症状为起病徐缓，刺激症状轻微，早期溃疡为浅在性，表面为灰白或乳白色“苔垢”状物所覆盖，外观干燥而少光泽，稍隆起，“苔垢”状物易剔去，基质层有菌丝繁殖，浸润较为致密，边界因菌丝伸向四周，形成伪足，在其外围分布有点状混浊，形成所谓卫星病灶。有时浸润边缘因胶原溶解而出现浅沟。在浸润向深部发展时，组织坏死脱落，形成明显溃疡。随着真菌毒素侵入前房，引起虹膜炎及前房积脓，晚期积脓质地粘稠，其内常含真菌。溃疡最后可以穿破引起眼内炎。整个病程发展较为缓慢，可长达2～3个月。因真菌菌丝有向深部生长的能力，故易反复发作，有时溃疡初步愈合，但旋又复发。