多数肛周脓肿切开排脓后仍需手术根治。处理方式主要有引流后观察、抗生素治疗、肛瘘切除术、挂线疗法。
1、引流后观察
浅表脓肿切开后若无感染扩散可暂不手术，但需每日消毒换药，复发概率较高。
2、抗生素治疗
合并全身感染时需用头孢克肟、甲硝唑、左氧氟沙星等药物控制炎症，但不能根治潜在瘘管。
3、肛瘘切除术
脓肿多由肛腺感染引起，约70％会形成肛瘘，需手术切除瘘管避免反复发作。
4、挂线疗法
高位复杂性肛瘘可采用橡皮筋挂线缓慢切割，减少肛门失禁风险。
术后保持肛门清洁，避免久坐久站，饮食需增加膳食纤维预防便秘，定期复查瘘管愈合情况。