治疗扁平疣可使用水杨酸软膏、维A酸乳膏、咪喹莫特乳膏、氟尿嘧啶软膏等药物，需在医生指导下根据皮损情况选择合适剂型。
1、水杨酸软膏
通过角质剥脱作用使疣体脱落，适用于表皮增厚型扁平疣，可能出现局部刺激反应。
2、维A酸乳膏
调节表皮细胞分化，抑制疣体增殖，适用于面部等薄嫩部位，需避光使用。
3、咪喹莫特乳膏
免疫调节剂可诱导局部细胞因子产生，适用于顽固性扁平疣，可能出现红斑等免疫反应。
4、氟尿嘧啶软膏
抗代谢药物能干扰病毒DNA合成，适用于多发疣体，需警惕周围正常皮肤刺激。
治疗期间避免搔抓皮损，保持患处清洁干燥，合并感染或泛发者需及时就医综合治疗。