半夜两点胃痛的原因是反流性食管炎或者是十二指肠球部溃疡，这两种病都是因为胃酸增多而造成。因为晚上两点时胃处于空腹状态胃酸增多，刺激胃食管粘膜糜烂灶或溃疡壁的末梢神经，会造成胃痛的症状。患者可以做胃镜检查，明确诊断。而造成慢性胃病的原因常常是幽门螺杆菌感染。患者还可以做碳13或碳14呼气试验检查，明确有无幽门螺杆菌感染。如果结果阳性，可以选择四联方案根除幽门螺杆菌治疗，就是一种ppi+2种抗生素加一种铋剂，疗程是7天到14天。如果没有幽门螺杆菌感染，可以选择ppi类药物，h2受体阻滞剂，胃粘膜保护药，促胃肠动力药等治疗。