月经颜色发黑且量少并伴有腰疼，可能是由子宫内膜炎、子宫肌瘤、多囊卵巢综合征、宫颈炎等疾病引起。子宫内膜炎通常由细菌感染导致，炎症刺激会改变月经颜色和量，伴随腰疼，需遵医嘱用药治疗；子宫肌瘤可能因遗传或激素异常引起，雌激素过多会导致肌瘤压迫局部组织，影响月经并引发腰疼，严重时需手术治疗；多囊卵巢综合征由遗传或环境因素导致，雄激素水平升高会影响排卵和月经，医生指导下用药可缓解症状；宫颈炎由病原菌感染引起，炎症反应可导致阴道出血和腹痛、腰疼，需遵医嘱用药治疗。建议患者及时就医，完善检查后进行针对性治疗。