剪短指甲后抠肉疼且长出后仍然疼痛，可能是由于指甲修剪不当、皮肤干燥、感染或嵌甲等原因引起的，正确修剪指甲的方法是先剪平指甲的两端，然后再修剪中间部分，使指甲的长度与指尖平齐或略长于指尖，以避免指甲边缘抠肉；皮肤干燥会导致指甲周围的皮肤开裂引起疼痛，可以使用含有保湿成分的护手霜保持皮肤湿润；如果是感染导致的疼痛，可以使用抗感染药物如夫西地酸乳膏或莫匹罗星软膏涂抹在感染部位；另外，如果是嵌甲问题，可以使用棉球或棉签垫在指甲和肉之间缓解疼痛，严重时可能需要手术治疗，如果上述方法无法缓解疼痛，建议及时就医明确病因并遵医嘱治疗。