生鸡蛋的营养吸收率通常低于熟鸡蛋，部分营养成分可能无法被人体充分吸收。生鸡蛋可能含有沙门氏菌等致病微生物，存在食品安全风险。
鸡蛋经过加热后，蛋白质结构发生变性，更易于人体消化吸收。生鸡蛋的蛋白质吸收率约为50％，而熟鸡蛋可达90％以上。生鸡蛋中含有抗胰蛋白酶，会抑制蛋白质分解，影响吸收效率。生物素是鸡蛋中的重要维生素，生鸡蛋中的抗生物素蛋白会与生物素结合，导致其无法被人体利用。蛋黄中的铁元素在加热后释放更充分，吸收率可提升数倍。生鸡蛋的脂肪消化率也低于熟鸡蛋，加热能使脂肪乳化更充分。
生鸡蛋可能携带沙门氏菌、大肠杆菌等致病菌，食用后可能引发食物中毒。儿童、孕妇、老年人等免疫力较低人群尤其需要注意。生鸡蛋的蛋清中含有卵白素，长期大量食用可能影响生物素代谢。部分人群对生鸡蛋中的蛋白质成分更敏感，可能引发过敏反应。某些特殊饮食方式如寿司、提拉米苏等会使用生鸡蛋，建议选择经过巴氏杀菌的蛋制品。
建议将鸡蛋加热至蛋黄和蛋白完全凝固后食用，既能保证营养吸收又可避免食品安全风险。煎蛋、水煮蛋、蒸蛋等烹饪方式都能有效提高鸡蛋营养利用率。储存鸡蛋时应冷藏保存，避免交叉污染。选购鸡蛋时注意检查蛋壳是否完整清洁。特殊人群如健身爱好者若需补充生鸡蛋，应选择经过灭菌处理的液态蛋产品。
