小儿氨基酸制剂在合理使用下通常安全，但可能出现胃肠道不适、过敏反应、代谢异常及肝肾负担等副作用。
1、胃肠道不适部分儿童服用后可能出现恶心、腹泻或腹胀，与氨基酸浓度或渗透压过高有关，建议家长从小剂量开始逐步增加，必要时更换为低渗透压配方。
2、过敏反应少数患儿对特定氨基酸成分过敏，表现为皮疹或呼吸困难，家长需立即停用并就医，可考虑改用深度水解蛋白配方。
3、代谢异常长期过量使用可能导致血氨升高或酸中毒，常见于肝肾功能不全患儿，需定期监测电解质水平并调整剂量。
4、肝肾负担高蛋白代谢会增加肝肾工作量，对于早产儿或先天代谢缺陷儿童，应在医生指导下严格控制摄入量。
使用期间家长需观察患儿精神状态与排便情况，避免与高蛋白食物同服，定期复查肝肾功能指标。
