磷酸氯喹片对疟疾、类风湿关节炎、系统性红斑狼疮等疾病有一定治疗效果，其疗效主要与疾病类型、药物敏感性、个体差异、用药方案等因素有关。
1、疟疾治疗磷酸氯喹片通过抑制疟原虫裂殖体增殖发挥抗疟作用，对间日疟和三日疟原虫敏感株有效，临床常与伯氨喹联用根治疟疾，常见药物包括磷酸氯喹片、硫酸羟氯喹片、青蒿琥酯片。
2、免疫调节该药可调节免疫细胞功能，抑制自身抗体产生，用于类风湿关节炎和红斑狼疮的辅助治疗，需配合甲氨蝶呤、来氟米特等抗风湿药物使用。
3、药物敏感性部分疟原虫已对磷酸氯喹产生耐药性，用药前应进行药敏检测，耐药情况下需换用双氢青蒿素哌喹片或蒿甲醚本芴醇片。
4、个体差异肝功能异常者需调整剂量，葡萄糖六磷酸脱氢酶缺乏患者可能诱发溶血，用药期间须监测视力、心电图及血常规。
使用磷酸氯喹片须严格遵医嘱，避免与胺碘酮等QT间期延长药物联用，出现视力模糊或心悸应立即停药就医。
