真菌性肠炎可通过粪便真菌培养、血清学检测、结肠镜检查、组织病理学检查等方法诊断。
1、粪便真菌培养
采集新鲜粪便样本进行真菌培养，若检出白色念珠菌等致病真菌可辅助诊断，需结合临床表现判断。
2、血清学检测
检测血液中真菌抗原或抗体水平，如β-D-葡聚糖检测对侵袭性真菌感染有较高特异性。
3、结肠镜检查
镜下可见肠黏膜充血水肿、白色伪膜样病变，活检组织可发现真菌菌丝侵入黏膜层。
4、组织病理学
肠黏膜活检标本经特殊染色（如PAS染色）发现真菌菌丝或孢子是确诊的金标准。
免疫功能低下患者出现慢性腹泻时应警惕真菌性肠炎，确诊后需规范抗真菌治疗并加强营养支持。
