鼻囊肿能否自愈与囊肿类型有关，部分黏液囊肿可能自行消退，但多数情况下需医疗干预。常见类型包括鼻前庭囊肿、鼻窦黏液囊肿，处理方式主要有观察随访、药物引流、穿刺抽吸、手术切除。
体积较小的无症状囊肿可定期复查，部分黏液囊肿可能因鼻腔压力变化自行破裂吸收，期间需监测是否出现鼻塞、面部胀痛等进展症状。
合并感染时需抗生素控制炎症，常用药物包括阿莫西林克拉维酸钾、头孢克洛、克拉霉素，配合鼻腔冲洗促进分泌物排出，但无法根治囊肿结构。
适用于囊液稀薄的表浅囊肿，通过穿刺排出液体暂时缓解压迫症状，存在复发风险，术后需配合使用糠酸莫米松鼻喷雾剂减少渗出。
鼻内镜下囊肿摘除术是根治方法，适用于反复感染或压迫周围组织的病例，术后需定期换药避免粘连，合并鼻窦炎者需同期行窦口开放术。
日常应避免用力擤鼻及鼻腔外伤，保持环境湿度，出现持续鼻塞、嗅觉减退或头痛时应及时就诊评估囊肿进展。
