艾草根具有温经止血、散寒止痛、祛湿止痒、抗菌消炎等功效，主要用于虚寒性出血、痛经、湿疹瘙痒及部分感染性疾病。
艾草根性温，能温通经脉，适用于虚寒性月经过多、崩漏等出血症状。可配伍阿胶、当归等药物增强疗效，常见剂型有煎剂、艾条、艾绒。
对寒凝气滞导致的脘腹冷痛、痛经有缓解作用。常与香附、川芎同用，可制成艾附暖宫丸等中成药，或外用艾灸直接作用于穴位。
所含挥发油成分对湿疹、荨麻疹等皮肤瘙痒有效。可煎汤外洗或配伍地肤子、白鲜皮制成洗剂，也可加工为艾草精油局部涂抹。
艾叶油对金黄色葡萄球菌等致病菌有抑制作用，可用于辅助治疗足癣、阴道炎。常制成栓剂、洗液等剂型，与苦参、黄柏联用效果更佳。
使用艾草根需辨证施治，阴虚血热者慎用；新鲜艾草含微量毒性成分，建议炮制后使用；孕妇及过敏体质者应在医师指导下使用。
