细菌分析主要用于检查感染性疾病、炎症反应、耐药性评估及微生物定植情况，常见检测项目包括细菌培养、药敏试验、涂片镜检和分子生物学检测。
通过分离培养明确致病菌种类，如肺炎链球菌引起的肺炎或大肠埃希菌导致的尿路感染，需结合临床症状和实验室指标综合判断。
检测分泌物或体液中白细胞吞噬细菌现象，辅助鉴别细菌性与非细菌性炎症，如细菌性脑膜炎与病毒性脑膜炎的鉴别。
采用药敏试验测定细菌对各类抗生素的敏感性，指导临床用药选择，例如耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的筛查。
评估特定部位细菌群落构成，常见于术前筛查（如鼻腔MRSA定植）或危重患者感染风险预测。
检查前需根据检测类型规范采集标本，避免污染影响结果准确性，呼吸道标本建议晨起深部咳痰，尿液标本应取清洁中段尿。
