直肠炎就诊科室主要有消化内科、肛肠外科、胃肠外科、普通外科。
多数直肠炎患者首选消化内科，该科室擅长诊治炎症性肠病等非感染性直肠病变，伴有腹泻、黏液便等症状时可优先选择。
当直肠炎合并肛周脓肿、肛瘘等并发症，或出现肛门坠胀、排便困难等局部症状时，需转诊至肛肠外科进行专科处理。
疑似溃疡性直肠炎需手术干预，或出现肠梗阻、穿孔等急症时，胃肠外科可提供手术及围术期管理。
基层医院若无专科分诊，急性直肠炎伴发热等全身症状者可先至普通外科排查急腹症。
出现血便持续超过3天或伴随剧烈腹痛时，建议立即就医完善肠镜检查明确病因。
