苯酰甲硝唑分散片主要用于治疗厌氧菌感染、滴虫病、阿米巴病等疾病，具有抗菌、抗原虫作用，常见适应症包括阴道炎、牙龈炎、腹腔感染等。
苯酰甲硝唑分散片对脆弱拟杆菌、梭状芽孢杆菌等厌氧菌有较强抑制作用，可用于治疗腹腔感染、盆腔炎等，临床常用药物包括甲硝唑片、替硝唑胶囊、奥硝唑分散片。
该药物能杀灭阴道毛滴虫、溶组织内阿米巴等原虫，适用于滴虫性阴道炎、阿米巴痢疾等，治疗时可配合使用克霉唑栓、制霉菌素片等抗真菌药物。
作为三联疗法组成药物之一，联合克拉霉素、奥美拉唑用于根除胃部幽门螺杆菌感染，相关药物还包括胶体果胶铋胶囊、阿莫西林胶囊等。
在结直肠手术前预防性使用可降低厌氧菌感染风险，需与头孢类抗生素联用，类似用途药物包含左氧氟沙星片、头孢呋辛酯片等。
使用苯酰甲硝唑分散片期间应戒酒，避免与含乙醇药物同服，用药后可能出现恶心、头痛等不良反应，孕妇及哺乳期妇女禁用。
