肛门镜和肠镜检查的疼痛感因人而异，多数患者认为肛门镜不适感较轻，肠镜可能因检查范围较大产生腹胀或短暂绞痛。
肛门镜主要检查直肠末端和肛管，检查时间短，通常仅有肛门扩张的轻微胀痛，敏感者可出现短暂刺痛。
肠镜需检查全部结肠，注气扩张肠道可能引起明显腹胀，过肠弯时可能出现牵拉痛，但无痛肠镜可完全避免不适。
疼痛感知与个体耐受性相关，既往腹部手术史、肠粘连患者可能痛感更明显，焦虑情绪会放大不适体验。
普通检查可通过调整呼吸缓解不适，无痛检查使用静脉麻醉能消除痛苦，但需评估心肺功能及麻醉风险。
检查前遵医嘱清洁肠道，检查后避免剧烈运动，出现持续腹痛或便血需及时就医。
