卵巢囊肿患者可遵医嘱使用桂枝茯苓胶囊、红金消结胶囊、散结镇痛胶囊等中成药，或屈螺酮炔雌醇片等西药。药物选择需根据囊肿性质、症状及个体差异由医生综合评估。
桂枝茯苓胶囊具有活血化瘀作用，适用于气滞血瘀型囊肿；红金消结胶囊可软坚散结，常用于乳腺及卵巢良性肿块；散结镇痛胶囊能缓解囊肿引起的疼痛症状。
屈螺酮炔雌醇片等短效避孕药可抑制卵巢排卵，减少功能性囊肿形成，适用于生理性囊肿反复发作者。使用时需排除激素使用禁忌证。
合并感染的卵巢囊肿可能需要头孢克肟、甲硝唑等抗生素控制炎症。需通过血常规、病原学检查明确感染类型后针对性用药。
布洛芬缓释胶囊等非甾体抗炎药可用于缓解急性疼痛，但须在医生指导下短期使用，避免掩盖病情进展。
卵巢囊肿用药期间应定期复查超声，观察囊肿变化；避免剧烈运动导致囊肿扭转破裂；保持规律作息，减少高雌激素食物摄入。
