头颅磁共振主要用于排查中枢神经系统病变导致的睡眠呼吸暂停，常见病因包括脑干发育异常、脑卒中、肿瘤压迫等，但对上呼吸道结构异常等外周病因检出率有限。
头颅磁共振可清晰显示脑干及周围结构，有助于诊断先天性脑干发育不良、延髓空洞症等中枢性呼吸调节异常疾病，这类患者多伴有夜间血氧饱和度显著下降。
对于脑卒中后遗症、多系统萎缩等神经系统退行性疾病，磁共振能发现基底动脉供血不足、脑桥萎缩等病理改变，这些病变可能通过影响呼吸中枢导致睡眠呼吸暂停。
颅后窝肿瘤、小脑扁桃体下疝等占位性病变可通过磁共振明确诊断，当肿瘤压迫延髓呼吸中枢时，可能表现为顽固性夜间呼吸暂停伴白天嗜睡。
对于肥胖、鼻中隔偏曲、扁桃体肥大等上呼吸道阻塞性病因，头颅磁共振检查价值有限，需结合多导睡眠监测和耳鼻喉科专科检查综合判断。
怀疑睡眠呼吸暂停需进行多学科评估，中枢性病因患者应同步完善肺功能及血气分析，阻塞性病因患者建议进行电子喉镜和睡眠监测检查。
