病毒性腮腺炎多数不会遗留后遗症，少数可能并发睾丸炎、卵巢炎或听力损伤。后遗症发生概率与患者年龄、免疫状态及并发症严重程度有关。
青春期后男性患者可能因腮腺炎病毒侵犯睾丸导致炎症，表现为阴囊肿胀疼痛。急性期需卧床休息并使用镇痛药物如布洛芬、对乙酰氨基酚或塞来昔布，严重者需糖皮质激素干预。
女性患者偶见卵巢受累，可能出现下腹痛或月经紊乱。治疗以对症为主，可选用非甾体抗炎药如双氯芬酸钠、萘普生或洛索洛芬钠，合并细菌感染时需加用抗生素。
病毒侵袭内耳可能导致单侧感音神经性耳聋，发生率较低但多为永久性损害。早期发现可通过泼尼松等糖皮质激素冲击治疗，后期需考虑助听器或人工耳蜗植入。
部分患者出现上腹剧痛伴呕吐，血清淀粉酶升高提示胰腺受累。治疗需禁食补液，疼痛剧烈时可使用哌替啶、曲马多或吗啡等镇痛药物，多数2周内恢复。
患病期间保持口腔清洁，选择流质饮食避免酸性刺激，出现头痛呕吐或持续发热应及时复查。疫苗接种是预防并发症最有效手段。
