肠镜检查存在交叉感染风险，但概率极低。主要风险因素包括内镜消毒不彻底、操作流程不规范、患者免疫力低下、医疗机构感染控制缺失。
重复使用的肠镜若未达到灭菌标准，可能残留病原体。正规医疗机构均采用全自动清洗消毒机，严格遵循消毒时间与化学剂浓度标准。
医护人员未执行手卫生或防护措施不到位时可能传播病原体。现行规范要求检查时使用一次性活检钳、注射针等附件。
艾滋病、器官移植术后等免疫缺陷患者更易发生机会性感染。这类患者检查前需评估感染风险，必要时预防性使用抗生素。
消毒区域与清洁区域未物理隔离、空气消毒不合格的机构风险较高。选择通过JCI认证或三级医院内镜中心可最大限度规避风险。
建议检查前确认机构消毒资质，术后出现持续发热、腹痛需及时就医。目前正规医疗机构的交叉感染率已控制在十万分之一以下。
