豆浆煮沸后一般可以食用，但需要持续沸腾5-10分钟以彻底破坏其中的抗营养因子。未充分加热的豆浆可能引起胃肠不适，甚至中毒。
豆浆中含有胰蛋白酶抑制剂和皂苷等抗营养因子，这些物质在80℃左右时活性最高，可能刺激胃肠黏膜导致恶心、呕吐或腹泻。当豆浆加热至100℃并持续沸腾5分钟以上，这些物质会被有效分解。家庭自制豆浆时，需注意观察沸腾状态，避免假沸现象。豆浆在加热过程中可能出现泡沫上涌的假沸现象，此时温度仅达90℃左右，需调小火候继续煮沸至泡沫消散。
市售预包装豆浆通常经过超高温灭菌处理，开封后可直接饮用或加热至60℃左右饮用。但自制豆浆或散装豆浆必须煮沸后饮用，尤其对于儿童、老人及消化功能较弱的人群。储存超过6小时的豆浆即使煮沸也应谨慎食用，微生物繁殖可能产生耐热性毒素。若饮用豆浆出现口唇麻木、头晕等症状，应立即就医处理。
建议使用带温度显示的煮浆器具，确保中心温度达到100℃。饮用前可搅拌观察质地，充分煮沸的豆浆质地均匀无豆腥味。日常可将煮沸后的豆浆迅速冷却至4℃冷藏保存，并在24小时内饮用完毕。搭配谷物类食物食用可提高蛋白质吸收率，避免空腹饮用大量豆浆。
