肛瘘可能引起肛周脓肿、肛门失禁、直肠阴道瘘、肛管癌等疾病，按病情发展从轻到重排列。
肛瘘未及时治疗可能导致反复肛周感染形成脓肿，表现为局部红肿热痛，需手术切开引流配合抗生素如头孢克肟、甲硝唑、左氧氟沙星治疗。
长期肛瘘可能损伤肛门括约肌，导致排便控制障碍，可通过生物反馈训练或括约肌修复手术改善，严重者需使用止泻药如蒙脱石散调节排便。
女性高位肛瘘可能穿透直肠阴道隔形成异常通道，引发阴道排气排粪，需手术修补瘘管并预防感染，术后可使用乳果糖软化粪便。
慢性炎症刺激可能增加肛管鳞状细胞癌风险，表现为肛周溃疡或肿块，确诊需病理活检，治疗包括放化疗和腹会阴联合切除术。
肛瘘患者应保持肛门清洁干燥，避免久坐久站，饮食注意补充膳食纤维预防便秘，出现发热或持续疼痛需及时就医。
