扁桃体肥大在儿童中可能自愈，成人自愈概率较低。扁桃体肥大的处理方式主要有观察等待、药物治疗、手术治疗、免疫调节。
儿童扁桃体肥大可能随年龄增长自然缩小，家长需定期观察孩子呼吸、吞咽情况，若无明显症状可暂不干预。
急性感染导致的肥大可使用阿莫西林、头孢克洛等抗生素，或布地奈德雾化减轻水肿。药物治疗需在医生指导下进行。
反复感染或严重阻塞呼吸时需行扁桃体切除术，常见术式有传统剥离法和低温等离子消融术。手术适应证需由耳鼻喉科医生评估。
过敏体质者可通过孟鲁司特钠等药物控制免疫反应，减少扁桃体增生。日常避免接触尘螨、花粉等过敏原。
保持口腔清洁，避免辛辣刺激饮食，适当补充维生素C增强免疫力。若出现睡眠呼吸暂停、进食困难等症状应及时就医。
