牙周炎治疗常用药物主要有甲硝唑、阿莫西林、多西环素、米诺环素等抗生素，以及氯己定含漱液等局部用药。
甲硝唑可抑制厌氧菌感染，适用于牙周炎伴牙龈脓肿的情况，可能出现胃肠道反应，须遵医嘱使用。
阿莫西林作为广谱青霉素类抗生素，适用于中重度牙周炎，需注意过敏反应，临床常与甲硝唑联用。
多西环素可通过抑制胶原酶活性延缓牙槽骨吸收，适用于侵袭性牙周炎，用药期间需避免日晒。
氯己定含漱液可控制菌斑生物膜，辅助缓解牙龈出血，需配合专业龈下刮治才能达到理想效果。
牙周炎药物治疗需结合超声洁治等机械治疗，日常使用软毛牙刷及牙线清洁，定期进行牙周维护。
