脑膜炎可能遗留后遗症，常见后遗症包括听力障碍、认知功能下降、运动障碍、癫痫发作等。后遗症发生概率与病原体类型、治疗时机、病情严重程度等因素相关。
细菌性脑膜炎易损伤听神经，表现为单侧或双侧听力减退。早期使用糖皮质激素可能降低风险，严重者需佩戴助听器或植入人工耳蜗。
炎症可能造成脑实质损伤，导致记忆力减退或注意力不集中。康复期需进行认知训练，必要时使用改善脑代谢药物如吡拉西坦。
基底节区受累可能出现肢体僵硬或震颤。物理治疗可改善运动功能，严重痉挛可注射A型肉毒毒素缓解症状。
脑膜粘连或皮质瘢痕可能成为致痫灶。需长期服用抗癫痫药物如丙戊酸钠，定期复查脑电图监测病情。
脑膜炎康复期应保证充足营养摄入，适当进行有氧运动促进神经功能恢复，出现异常症状需及时复查头颅影像学检查。
