扁平疣通常可遵医嘱使用维A酸乳膏、咪喹莫特乳膏、氟尿嘧啶软膏等药物，也可采用水杨酸制剂辅助治疗。
维A酸乳膏通过调节表皮细胞分化抑制疣体增生，适用于轻中度扁平疣，可能出现局部脱屑或红斑等刺激反应。
咪喹莫特乳膏为免疫调节剂，能诱导局部细胞因子产生清除病毒，对顽固性疣体效果较好，使用后可能出现灼热感。
氟尿嘧啶软膏通过干扰DNA合成抑制疣体生长，适用于多发疣体，需注意可能引起周围正常皮肤色素沉着。
水杨酸通过角质剥脱作用促使疣体脱落，常作为辅助治疗，浓度过高可能导致皮肤刺激需分次使用。
治疗期间避免搔抓疣体防止扩散，保持患处清洁干燥，若药物效果不佳可考虑冷冻或激光等物理治疗。
