扁平疣通常采用冷冻治疗，主要通过液氮低温破坏疣体组织达到清除效果。治疗方法包括冷冻治疗、药物治疗、激光治疗、免疫调节治疗。
液氮冷冻能使疣体细胞快速冷冻坏死，适用于数量少、体积小的疣体。治疗时可能出现短暂疼痛或水疱，需避免自行抓挠。
水杨酸软膏可促进角质剥脱，咪喹莫特乳膏通过免疫调节作用清除病毒，氟尿嘧啶软膏抑制细胞增殖。药物治疗适用于不宜冷冻的特殊部位。
二氧化碳激光可精准汽化疣体组织，适用于顽固性或较大疣体。治疗后需保持创面干燥，防止继发感染。
干扰素注射或口服转移因子可增强局部免疫功能，降低复发概率。适用于反复发作或多发性扁平疣患者。
治疗期间应避免搔抓患处，保持皮肤清洁干燥，饮食注意补充维生素A和锌元素以促进皮肤修复。
