内膜垫缺损手术时机通常建议在确诊后3-6个月内进行，具体时间需根据缺损程度、心脏功能、合并畸形及患儿生长发育情况综合评估。
部分型内膜垫缺损若症状轻微可暂缓手术，完全型缺损或伴有肺动脉高压者需尽早干预，手术时机可能提前至出生后3-6个月。
反复出现心力衰竭、药物控制不佳的患儿需限期手术，心功能稳定者可择期在1-2岁前完成手术。
合并法洛四联症、大动脉转位等复杂先心病时，需制定分期手术方案，首次手术多在6月龄内进行。
体重低于5公斤或存在严重营养不良时需先进行营养支持，待体重达标后再行手术，但最晚不宜超过2周岁。
术后需定期复查心脏超声，避免剧烈运动，保证高蛋白饮食促进组织修复，家长应密切观察有无气促、发绀等异常症状。
