粪便检查可筛查消化道出血、肠道感染、消化吸收功能异常、寄生虫感染等疾病，主要通过分析粪便的性状、成分及微生物等指标辅助诊断。
通过隐血试验检测肉眼不可见的微量出血，可能与痔疮、胃溃疡、结肠息肉等因素有关，常用试剂为愈创木酯法或免疫化学法。
检测致病菌如沙门氏菌、志贺氏菌，或轮状病毒等病原体，常伴随腹泻、发热症状，需结合粪便培养或抗原检测确诊。
通过脂肪定量试验判断胰腺功能，脂肪泻患者粪便中可见未消化脂肪滴，可能与慢性胰腺炎、乳糜泻等疾病相关。
显微镜检可发现蛔虫卵、钩虫卵等寄生虫证据，疫区居民或生食习惯者易感，需配合阿苯达唑等驱虫药物治疗。
检查前3天避免食用动物血制品，留取新鲜标本后尽快送检，婴幼儿需注意采集时避免尿液污染。
