巨细胞病毒感染多数可以痊愈，免疫功能正常者通常呈自限性，治疗方式主要有抗病毒药物、免疫调节、对症支持、预防并发症。
更昔洛韦、缬更昔洛韦等核苷类似物可抑制病毒复制，适用于免疫功能低下或重症患者，需监测血常规及肾功能。
静脉注射免疫球蛋白可用于先天感染或移植患者，通过被动免疫中和病毒颗粒，降低病毒载量。
发热者可用物理降温，肝功能异常需保肝治疗，合并肺炎时给予氧疗，维持水电解质平衡。
视网膜炎需玻璃体注射更昔洛韦，肺炎患者可能需机械通气，肠炎引发穿孔时须外科干预。
感染者应保证优质蛋白摄入，避免生冷食物，定期复查病毒载量及脏器功能，免疫功能低下者需长期随访。
