结膜炎多数可以治愈，但部分类型可能反复发作或迁延不愈。治疗效果主要与病因类型、治疗规范性、个人体质、伴随疾病等因素有关。
病毒性结膜炎通常具有自限性，细菌性结膜炎通过抗生素治疗可痊愈，过敏性结膜炎需长期控制过敏原，衣原体性结膜炎易转为慢性。
未完成全程用药、擅自停药或错误使用激素类眼药水可能导致病情反复。细菌性结膜炎需使用左氧氟沙星滴眼液、妥布霉素滴眼液等足疗程治疗。
过敏体质患者接触花粉、尘螨等过敏原时易复发。过敏性结膜炎可选用奥洛他定滴眼液、氮卓斯汀滴眼液配合抗组胺药物控制症状。
干眼症、睑缘炎等眼部基础疾病会延缓愈合。需同步治疗原发病，如使用玻璃酸钠滴眼液改善干眼，配合睑缘清洁护理。
建议避免揉眼、保持用眼卫生，急性期冷敷缓解充血，慢性期热敷促进血液循环，长期不愈需排查全身免疫性疾病可能。
