从肛门灌水清肠可能引起肠道菌群紊乱、电解质失衡、肠黏膜损伤、肠穿孔等风险，临床主要用于术前肠道准备或严重便秘的医疗干预。
灌水清肠会冲刷肠道内正常菌群，可能导致腹泻或继发感染，需通过益生菌制剂如双歧杆菌三联活菌、酪酸梭菌活菌、地衣芽孢杆菌调节。
大量液体灌入可能稀释体内钠钾离子，引发乏力或心律失常，需监测电解质并补充氯化钠注射液、口服补液盐、门冬氨酸钾镁。
操作不当可能造成直肠黏膜机械性损伤，表现为出血或疼痛，可使用康复新液、蒙脱石散、生长抑素促进黏膜修复。
高压灌肠可能诱发肠壁破裂，属于急腹症需立即手术，常见处理方式包括肠造口术或肠段切除术。
日常便秘建议通过增加蔬菜水果摄入、规律运动等自然方式改善，医疗灌肠须在专业人员操作下进行。
