亚急性甲状腺炎的危害主要包括暂时性甲状腺功能亢进、持续性甲状腺功能减退、甲状腺肿大压迫症状及复发风险，多数患者预后良好但需规范治疗。
炎症破坏甲状腺滤泡导致甲状腺激素释放入血，可能出现心悸、多汗、体重下降等甲亢症状，通常使用普萘洛尔缓解症状，严重时可短期服用甲巯咪唑。
约20％患者因甲状腺组织破坏进展为永久性甲减，表现为乏力、畏寒、便秘，需长期口服左甲状腺素钠进行替代治疗并定期监测甲状腺功能。
甲状腺显著肿大可能压迫气管或食管，引发呼吸困难、吞咽困难，超声引导下穿刺抽吸可缓解压迫，必要时行糖皮质激素冲击治疗。
未规范治疗者复发率较高，复发时症状往往较初次发作更严重，建议全程足量使用泼尼松等抗炎药物并逐渐减量，避免自行停药。
患病期间注意休息，避免高碘饮食，定期复查甲状腺超声和功能，出现颈部剧痛或发热需及时复诊。
