神经性头痛通常不会直接引起拉肚子，但两者可能因共同诱因或疾病同时出现，主要关联因素有自主神经紊乱、应激反应、胃肠功能紊乱、偏头痛伴随症状等。
长期紧张或焦虑可能导致自主神经失调，同时引发头痛和胃肠蠕动异常。建议通过规律作息、深呼吸训练调节，必要时遵医嘱使用谷维素、甲钴胺等营养神经药物。
急性应激状态下，身体释放的应激激素可能同时诱发头痛和腹泻。需缓解压力源，可短期使用洛哌丁胺止泻，配合布洛芬缓解头痛。
肠易激综合征等疾病可能因内脏敏感性增高，与头痛共病。治疗需调整饮食结构，医生可能开具匹维溴铵调节胃肠动力，辅以对乙酰氨基酚镇痛。
部分偏头痛发作可能伴随消化系统症状，与三叉神经-胃肠反射有关。急性期可使用佐米曲普坦终止发作，预防性治疗可选托吡酯。
若头痛与腹泻反复共现，建议完善胃肠镜和神经系统检查，日常避免摄入咖啡因、乳制品等常见触发因素，保持情绪稳定。
