大量牙菌斑可能引发龋齿、牙龈炎、牙周炎等口腔疾病，严重时可导致牙齿松动脱落。牙菌斑的危害主要有局部刺激、细菌感染、牙体破坏、全身影响。
牙菌斑长期刺激牙龈会导致红肿出血，日常需使用含氟牙膏刷牙配合牙线清洁，严重时可使用氯己定含漱液辅助控制菌斑。
菌斑中变形链球菌代谢产酸腐蚀牙釉质，可能引发龋齿并伴随冷热敏感，需定期进行专业洁治并使用氟化钠护齿剂。
钙化形成的牙结石会压迫牙周组织，可能造成牙龈萎缩和牙槽骨吸收，需通过龈下刮治清除结石并配合多西环素局部用药。
牙周致病菌可能通过血液循环引发心内膜炎等系统疾病，伴有口臭或咀嚼无力时应及时进行牙周系统治疗。
建议每日使用巴氏刷牙法清洁牙齿，每半年接受一次口腔检查与洁治，控制甜食摄入频率有助于减少牙菌斑堆积。
