慢性胃肠炎与急性胃肠炎的主要区别在于病程长短、症状表现和病因，慢性胃肠炎通常持续数月以上，急性胃肠炎起病急且病程短于两周。
急性胃肠炎病程通常在一周内缓解，慢性胃肠炎症状反复发作超过三个月。前者多由感染性因素诱发，后者常与长期饮食不当或免疫异常相关。
急性胃肠炎突发呕吐腹泻伴发热，慢性胃肠炎表现为间歇性腹痛腹胀。急性期可能出现脱水，慢性期易合并营养不良。
急性胃肠炎常见诺如病毒或沙门菌感染，慢性胃肠炎多与幽门螺杆菌或自身免疫有关。前者具有传染性，后者多为持续性刺激导致。
急性胃肠炎以补液和止泻为主，慢性胃肠炎需调节胃肠功能。前者常用蒙脱石散和口服补液盐，后者可能需要益生菌和胃肠动力药。
两类胃肠炎患者均需避免辛辣刺激饮食，急性期建议短期流质饮食，慢性期应建立规律进食习惯并定期复查胃镜。
