巨指症通常无法完全预防，但可通过产前基因检测、避免孕期有害物质暴露、定期儿童发育监测及早期手术干预降低风险。
有家族史者可通过产前基因筛查评估胎儿患病风险，目前尚无特效预防药物，但可提前制定出生后管理方案。
孕期避免接触辐射、化学毒物等致畸因素，补充叶酸等营养素有助于降低胎儿发育异常概率。
婴幼儿期定期检查手指生长速度，发现异常增粗需尽早就诊，早期干预可延缓畸形进展。
对已确诊患儿，在骨骺闭合前实施骨骺阻滞术或部分切除术可控制指骨过度生长，改善功能外观。
建议患者避免患指过度负重，选择宽松手套保护，术后需配合康复训练维持关节活动度。
