巧克力囊肿主要表现为痛经、慢性盆腔痛、性交痛、不孕，症状发展通常呈现从早期轻度不适到后期严重功能障碍的渐进过程。
进行性加重的痛经是典型表现，疼痛多始于月经前1-2天，持续至整个经期，可能与前列腺素分泌增加及囊肿内压力升高有关。
约三分之二患者出现非周期性下腹坠胀或腰骶部酸痛，疼痛程度与囊肿大小无直接关联，部分患者伴有排便不适感。
深部性交痛常见于子宫直肠陷凹处的囊肿，因性交时碰撞或牵拉病灶导致，可能伴随阴道后穹窿触痛结节。
40％患者合并不孕，主要与盆腔粘连、卵巢储备功能下降及免疫微环境改变有关，部分患者可能以不孕为首发就诊症状。
建议出现上述症状者尽早就诊妇科，通过超声检查结合肿瘤标志物检测明确诊断，日常避免剧烈运动以防囊肿破裂。
