芎菊上清片具有疏风清热、止痛明目的功效，主要用于外感风邪引起的头痛、头晕、目赤肿痛等症状，可缓解感冒、偏头痛、神经性头痛等疾病的不适。
芎菊上清片中的川芎、菊花等成分能疏散风热，适用于风热感冒初期出现的头痛、咽痛等症状，可配合板蓝根颗粒、银翘解毒片等药物使用。
该药对血管神经性头痛、偏头痛有缓解作用，可能与调节脑血管舒缩功能有关，严重头痛时可与布洛芬、对乙酰氨基酚等药物联用。
对于风热上攻导致的结膜充血、眼睛干涩等症状有一定改善效果，眼科疾病患者使用时建议联合玻璃酸钠滴眼液、更昔洛韦眼用凝胶等专科药物。
部分研究显示其成分可能通过抗炎作用调节免疫功能，但需避免与免疫抑制剂如环孢素、他克莫司等同时使用。
服药期间应忌食辛辣刺激食物，避免驾驶或高空作业，高血压、心脏病患者及孕妇需在医师指导下使用，出现皮疹等过敏反应应立即停药就医。
